Reedel, 24. augustil 2012. aastal kell 14 kaitseb Rya Ero Tartu ülikooli molekulaar- ja rakubioloogia instituudis Riia 23-217 doktoritööd "Modifier view of the bacterial ribosome" ("Bakteriaalne ribosoom modifitseeritud nukleosiidide vaatevinklist") molekulaarbioloogia erialal.
Juhendajad: TÜ MRI professor Jaanus Remme ja vanemteadur Aivar Liiv.
Oponent: Professor Roland K. Hartmann, Farmatseutilise Keemia Instituut, Philipps'i Ülikool Marburgis, Marburg, Saksamaa.
Lühikokkuvõte:
Ribosoomid on imepisikesed masinad, mis valmistavad geenides paikneva informatsiooni alusel valke. Ribosoomid on kõigis elusrakkudes üldehituselt sarnased kuigi detailides on ka palju erinevusi. Ribosoomid on keerulise ehitusega, koosnevad ribonukleiinhappest (rRNA) ja valkudest, kusjuures rRNA moodustab suurema osa ribosoomide massist. Päristuumsete organismide, sealhulgas ka inimeste, ribosoomid on suuremad ja keerulisema ehitusega kui bakterite ribosoomid, ent ribosoomide põhielemendid ja töömehanism on samad kõikides elusolendites. Kuna bakterite uurimine on tehniliselt ja eetiliselt lihtsam, on suurem osa informatsiooni ribosoomide ehituse ja töömehanismi aga ka ribosoomide enda valmistamise kohta saadud just bakteritest. rRNA koosneb pikast ribonukleotiidide (adeniinist, guaniinist, uridiinist ning tsütidiinist)ahelatest. Ribosoomide sünteesimise käigus muudetakse mõningate ribonukleotiidide omadusi spetsiaalsete valkude, modifikatsiooniensüümide, poolt. Muudetud omadustega nukleotiide kutsutakse modifitseeritud nukleotiidideks. Modifitseeritud nukleosiidid esinevad kõikides ribosoomides ning paiknevad ribosoomi talitluse seisukohalt olulistes piirkondades, ent nende tähtsus ribosoomide töö seisukohalt on teadmata. Meie tuvastasime modifikatsiooniensüümi, RlmH, mis on eriline selle poolest, et modifitseerib soolekepikese (Escherichia coli) ribosoomi suurema alamühiku olulises piirkonnas paiknevat pseudouridiini, mis on omakorda modifitseeritud nukleotiid. Lisaks on RlmH huvitav selle poolest, et modifitseerib juba praktiliselt valminud ning võimalik et juba valku tootvat ribosoomi. RlmH on teadaolevalt ainuke valk, mis vajab ribosoomi ühe alamühiku rRNA modifitseerimiseks mõlemat alamühikut. Meie oleme iseloomustanud RlmH töö jaoks vajalikke tingimusi ja oleme selgitanud mehanisme, mis tagavad RlmH valgu erilisuse.