Ülikooli 18 51005 Tartu linn, Tartu linn, Tartumaa EST
TARTU ÜLIKOOLI TEADLASED OSALEVAD UUTE DNA TEHNOLOOGIATE VÄLJATÖÖTAMISES
23.02.2009
Elusorganismide DNA järjestuse määramine on muutunud oluliseks
meetodiks nende uurimisel. Odav ja suure läbilaskevõimega DNA
järjestuse määramise tehnoloogia aitaks teha läbimurdelisi uuringuid
erinevatel aladel – geneetikas, meditsiinilises diagnostikas,
molekulaarbioloogias, mikrobioloogias, veterinaarias, looma- ja
taimesüstemaatikas ning ökoloogias.
Praegused DNA järjestuse määramise meetodid on optimiseeritud piirini,
kus neid ilma põhimõtteliste muudatusteta enam palju odavamaks teha ei
saa. Seetõttu on nii USA kui ka Euroopa Liit intensiivselt otsimas
lahendusi põhimõtteliselt uute DNA järjestuse määramise metoodikate
loomiseks.
Nimetatud kaheaastase CRAFT tüüpi pilootprojekti raames plaanitakse
luua ja testida uut DNA järjestuse määramise tehnoloogiat, mis põhineb
pööratavatel terminaatornukleotiididel. Lisaks sellele luuakse projekti
käigus antud nukleotiidide kasutamiseks sobiv ensüüm in vitro
evolutsiooni abil. Tehnoloogiat testitakse mikrokiipidel, mis on loodud
Tartu biotehnoloogiafirma Asper Biotech ja Rootsi nanotehnoloogia firma
Silex AB koostöös.
TÜ poolt osaleb projektis bioloogia-geograafiateaduskonna
bioinformaatika õppetooli töörühm prof Maido Remmi juhtimisel, kelle
ülesandeks on luua arvutusmetoodikad ja tarkvara prototüüp, mis
võimaldaks uute tehnoloogiate praktilist rakendamist. Kui projekt
osutub edukaks arendatakse selle tulemuste baasil välja kommertsiaalne
toode, milleks võidakse kaasata täiendavaid partnereid.
Projektis osalevad peale Tartu Ülikooli bioinformaatikute ja Tartu
biotehnoloogia ettevõtte Asper Biotech ka Rootsi ettevõted QUIAtech AB
ja Silex Microsystems AB, Leedu ettevõte Fermentas ja prof Joachim
Engels Frankfurdi Johann Wolfgang Goethe Ülikoolist. Prof Andrew
Griffiths, ISIS, Strasbourg, osaleb projektis teadusnõunikuna.
Projekt sai Euroopa Komisjoni poolsel hindamisel kõrge koha olles esimeste hulgas analoogsete taotluste seas.
Illari Lään
TÜ avalikkussuhete juht
INFO: TÜ bioinformaatika prof Maido Remm, tel 737 5001