bioinformaatika ja meditsiinilise genoomika vanemteadur | Tartu Ülikool

TÜ üksuste kontaktandmed

humanitaarteaduste ja kunstide valdkond
Faculty phone: 
737 5341
Faculty address: 
Jakobi 2, ruumid 116–121, 51014 Tartu
  • valdkonna dekanaat
    Faculty phone: 
    737 5341
    Faculty address: 
    Jakobi 2, ruumid 116–121, 51005 Tartu
  • ajaloo ja arheoloogia instituut
    Faculty phone: 
    737 5651
    Faculty address: 
    Jakobi 2, 51005 Tartu
  • eesti ja üldkeeleteaduse instituut
    Faculty phone: 
    737 5221
    Faculty address: 
    Jakobi 2, IV korrus, 51005 Tartu
  • filosoofia ja semiootika instituut
    Faculty phone: 
    737 5314
    Faculty address: 
    Jakobi 2, ruumid 309–352, 51005 Tartu
  • kultuuriteaduste instituut
    Faculty phone: 
    737 5223
    Faculty address: 
    Ülikooli 16, 51003 Tartu
  • maailma keelte ja kultuuride kolledž
    Faculty address: 
    Lossi 3, 51003 Tartu
  • usuteaduskond
    Faculty phone: 
    737 5300
    Faculty address: 
    Ülikooli 18-310, 50090 Tartu
  • Viljandi kultuuriakadeemia
    Faculty phone: 
    435 5232
    Faculty address: 
    Posti 1, 71004 Viljandi
sotsiaalteaduste valdkond
Faculty phone: 
737 5957
Faculty address: 
Lossi 36, 51003 Tartu
  • valdkonna dekanaat
    Faculty phone: 
    737 5900
    Faculty address: 
    Lossi 36, 51003 Tartu
  • haridusteaduste instituut
    Faculty phone: 
    737 6440
    Faculty address: 
    Salme 1a–29, 50103 Tartu
  • Johan Skytte poliitikauuringute instituut
    Faculty phone: 
    737 5582
    Faculty address: 
    Lossi 36–301, 51003 Tartu
  • majandusteaduskond
    Faculty phone: 
    737 6310
    Faculty address: 
    J. Liivi 4, 50409 Tartu
  • psühholoogia instituut
    Faculty phone: 
    737 5902
    Faculty address: 
    Näituse 2, 50409 Tartu
  • õigusteaduskond
    Faculty phone: 
    737 5390
    Faculty address: 
    Näituse 20–324, 50409 Tartu
  • ühiskonnateaduste instituut
    Faculty phone: 
    737 5188
    Faculty address: 
    Lossi 36, 51003 Tartu
  • Narva kolledž
    Faculty phone: 
    740 1900
    Faculty address: 
    Raekoja plats 2, 20307 Narva
  • Pärnu kolledž
    Faculty phone: 
    445 0520
    Faculty address: 
    Ringi 35, 80012 Pärnu
meditsiiniteaduste valdkond
Faculty phone: 
737 5326
Faculty address: 
Ravila 19, 50411 Tartu
  • valdkonna dekanaat
    Faculty phone: 
    737 5326
    Faculty address: 
    Ravila 19, 50411 Tartu
  • bio- ja siirdemeditsiini instituut
    Faculty phone: 
    737 4210
    Faculty address: 
    Biomeedikum, Ravila 19, 50411 Tartu
  • farmaatsia instituut
    Faculty phone: 
    737 5286
    Faculty address: 
    Nooruse 1, 50411 Tartu
  • hambaarstiteaduse instituut
    Faculty phone: 
    731 9856
    Faculty address: 
    Raekoja plats 6, 51003 Tartu
  • kliinilise meditsiini instituut
    Faculty phone: 
    737 5323
    Faculty address: 
    L. Puusepa 8, 50406 Tartu
  • peremeditsiini ja rahvatervishoiu instituut
    Faculty phone: 
    737 4190
    Faculty address: 
    Ravila 19, 50411 Tartu
  • sporditeaduste ja füsioteraapia instituut
    Faculty phone: 
    737 5360
    Faculty address: 
    Jakobi 5–205, 51005 Tartu
loodus- ja täppisteaduste valdkond
Faculty phone: 
737 5820
Faculty address: 
Vanemuise 46–208, 51014 Tartu
  • valdkonna dekanaat
    Faculty phone: 
    737 5820
    Faculty address: 
    Vanemuise 46–208, 51005 Tartu
  • arvutiteaduse instituut
    Faculty phone: 
    737 5445
    Faculty address: 
    J. Liivi 2, 50409 Tartu
  • Eesti mereinstituut
    Faculty phone: 
    671 8902
    Faculty address: 
    Mäealuse 14, 12618 Tallinn
  • füüsika instituut
    Faculty address: 
    W. Ostwaldi 1, 50411 Tartu
  • keemia instituut
    Faculty phone: 
    737 5261
    Faculty address: 
    Ravila 14a, 50411 Tartu
  • matemaatika ja statistika instituut
    Faculty phone: 
    737 5860
    Faculty address: 
    J. Liivi 2, 50409 Tartu
  • molekulaar- ja rakubioloogia instituut
    Faculty phone: 
    737 5011
    Faculty address: 
    Riia 23, 23b–134, 51010 Tartu
  • Tartu observatoorium
    Faculty phone: 
    737 4510
    Faculty address: 
    Observatooriumi 1, Tõravere, 61602 Tartumaa
  • tehnoloogiainstituut
    Faculty phone: 
    737 4800
    Faculty address: 
    Nooruse 1, 50411 Tartu
  • ökoloogia ja maateaduste instituut
    Faculty phone: 
    737 5835
    Faculty address: 
    Vanemuise 46, 51003 Tartu
Asutused
  • raamatukogu
    Faculty phone: 
    737 5702
    Faculty address: 
    W. Struve 1, 50091 Tartu
  • teaduskool
    Faculty phone: 
    737 5581
    Faculty address: 
    Uppsala 10, 51003 Tartu
  • genoomika instituut
    Faculty phone: 
    737 4000
    Faculty address: 
    Riia 23b, 51010 Tartu
  • muuseum
    Faculty phone: 
    737 5674
    Faculty address: 
    Lossi 25, 51003 Tartu
  • loodusmuuseum ja botaanikaaed
    Faculty phone: 
    737 6076
    Faculty address: 
    Vanemuise 46, 51003 Tartu
Tugiüksused
  • ettevõtlus- ja innovatsioonikeskus
    Faculty phone: 
    737 6339
    Faculty address: 
    Lossi 3, III korrus, 51003 Tartu
  • grandikeskus
    Faculty phone: 
    737 6215
    Faculty address: 
    Lossi 3, III korrus, 51003 Tartu
  • hankeosakond
    Faculty phone: 
    737 6632
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a, 51005 Tartu
  • infotehnoloogia osakond
    Faculty phone: 
    737 6000, arvutiabi: 737 5500
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a, 51005 Tartu
  • kantselei
    Faculty phone: 
    737 5606
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a, 51005 Tartu
  • kinnisvaraosakond
    Faculty phone: 
    737 5137
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a, 51005 Tartu
  • personaliosakond
    Faculty phone: 
    737 5145
    Faculty address: 
    Ülikooli 18, ruumid 302 ja 304, 50090 Tartu
  • rahandusosakond
    Faculty phone: 
    737 5125
    Faculty address: 
    Jakobi 4, 51005 Tartu
  • rektoraadi büroo
    Faculty phone: 
    737 5600
    Faculty address: 
    Ülikooli 18, 51014 Tartu
  • siseauditi büroo
    Faculty address: 
    Ülikooli 17–103, 51005 Tartu
  • Tallinna esindus
    Faculty phone: 
    737 6600
    Faculty address: 
    Teatri väljak 3, 10143 Tallinn
  • turundus- ja kommunikatsiooniosakond
    Faculty phone: 
    737 5687
    Faculty address: 
    Ülikooli 18, ruumid 102, 104, 209, 210, 50090 Tartu
  • õppeosakond
    Faculty phone: 
    737 5620
    Faculty address: 
    Ülikooli 18, 50090 Tartu
  • üliõpilasesindus
    Faculty phone: 
    737 5400
    Faculty address: 
    Ülikooli 18b, 51005 Tartu
Muud üksused
  • MTÜ Tartu Ülikooli Akadeemiline Spordiklubi
    Faculty phone: 
    737 5371
    Faculty address: 
    Ujula 4, 51008 Tartu
  • MTÜ Tartu Üliõpilasküla
    Faculty phone: 
    740 9959
    Faculty address: 
    Narva mnt 25, 51013 Tartu
  • MTÜ Tartu Üliõpilasmaja
    Faculty phone: 
    730 2400
    Faculty address: 
    Kalevi 24, Tartu
  • OÜ Tartu Ülikooli Kirjastus
    Faculty phone: 
    737 5945
    Faculty address: 
    W. Struve 1, 50091 Tartu
  • SA Tartu Ülikooli Kliinikum
    Faculty phone: 
    731 8111
    Faculty address: 
    L. Puusepa 1a, 50406 Tartu
  • Tartu Ülikooli Sihtasutus
    Faculty phone: 
    737 5852
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a–106, Tartu

TÜ üksuste kontaktandmed

humanitaarteaduste ja kunstide valdkond
Faculty phone: 
737 5341
Faculty address: 
Jakobi 2, ruumid 116–121, 51014 Tartu
  • valdkonna dekanaat
    Faculty phone: 
    737 5341
    Faculty address: 
    Jakobi 2, ruumid 116–121, 51005 Tartu
  • ajaloo ja arheoloogia instituut
    Faculty phone: 
    737 5651
    Faculty address: 
    Jakobi 2, 51005 Tartu
  • eesti ja üldkeeleteaduse instituut
    Faculty phone: 
    737 5221
    Faculty address: 
    Jakobi 2, IV korrus, 51005 Tartu
  • filosoofia ja semiootika instituut
    Faculty phone: 
    737 5314
    Faculty address: 
    Jakobi 2, ruumid 309–352, 51005 Tartu
  • kultuuriteaduste instituut
    Faculty phone: 
    737 5223
    Faculty address: 
    Ülikooli 16, 51003 Tartu
  • maailma keelte ja kultuuride kolledž
    Faculty address: 
    Lossi 3, 51003 Tartu
  • usuteaduskond
    Faculty phone: 
    737 5300
    Faculty address: 
    Ülikooli 18-310, 50090 Tartu
  • Viljandi kultuuriakadeemia
    Faculty phone: 
    435 5232
    Faculty address: 
    Posti 1, 71004 Viljandi
sotsiaalteaduste valdkond
Faculty phone: 
737 5957
Faculty address: 
Lossi 36, 51003 Tartu
  • valdkonna dekanaat
    Faculty phone: 
    737 5900
    Faculty address: 
    Lossi 36, 51003 Tartu
  • haridusteaduste instituut
    Faculty phone: 
    737 6440
    Faculty address: 
    Salme 1a–29, 50103 Tartu
  • Johan Skytte poliitikauuringute instituut
    Faculty phone: 
    737 5582
    Faculty address: 
    Lossi 36–301, 51003 Tartu
  • majandusteaduskond
    Faculty phone: 
    737 6310
    Faculty address: 
    J. Liivi 4, 50409 Tartu
  • psühholoogia instituut
    Faculty phone: 
    737 5902
    Faculty address: 
    Näituse 2, 50409 Tartu
  • õigusteaduskond
    Faculty phone: 
    737 5390
    Faculty address: 
    Näituse 20–324, 50409 Tartu
  • ühiskonnateaduste instituut
    Faculty phone: 
    737 5188
    Faculty address: 
    Lossi 36, 51003 Tartu
  • Narva kolledž
    Faculty phone: 
    740 1900
    Faculty address: 
    Raekoja plats 2, 20307 Narva
  • Pärnu kolledž
    Faculty phone: 
    445 0520
    Faculty address: 
    Ringi 35, 80012 Pärnu
meditsiiniteaduste valdkond
Faculty phone: 
737 5326
Faculty address: 
Ravila 19, 50411 Tartu
  • valdkonna dekanaat
    Faculty phone: 
    737 5326
    Faculty address: 
    Ravila 19, 50411 Tartu
  • bio- ja siirdemeditsiini instituut
    Faculty phone: 
    737 4210
    Faculty address: 
    Biomeedikum, Ravila 19, 50411 Tartu
  • farmaatsia instituut
    Faculty phone: 
    737 5286
    Faculty address: 
    Nooruse 1, 50411 Tartu
  • hambaarstiteaduse instituut
    Faculty phone: 
    731 9856
    Faculty address: 
    Raekoja plats 6, 51003 Tartu
  • kliinilise meditsiini instituut
    Faculty phone: 
    737 5323
    Faculty address: 
    L. Puusepa 8, 50406 Tartu
  • peremeditsiini ja rahvatervishoiu instituut
    Faculty phone: 
    737 4190
    Faculty address: 
    Ravila 19, 50411 Tartu
  • sporditeaduste ja füsioteraapia instituut
    Faculty phone: 
    737 5360
    Faculty address: 
    Jakobi 5–205, 51005 Tartu
loodus- ja täppisteaduste valdkond
Faculty phone: 
737 5820
Faculty address: 
Vanemuise 46–208, 51014 Tartu
  • valdkonna dekanaat
    Faculty phone: 
    737 5820
    Faculty address: 
    Vanemuise 46–208, 51005 Tartu
  • arvutiteaduse instituut
    Faculty phone: 
    737 5445
    Faculty address: 
    J. Liivi 2, 50409 Tartu
  • Eesti mereinstituut
    Faculty phone: 
    671 8902
    Faculty address: 
    Mäealuse 14, 12618 Tallinn
  • füüsika instituut
    Faculty address: 
    W. Ostwaldi 1, 50411 Tartu
  • keemia instituut
    Faculty phone: 
    737 5261
    Faculty address: 
    Ravila 14a, 50411 Tartu
  • matemaatika ja statistika instituut
    Faculty phone: 
    737 5860
    Faculty address: 
    J. Liivi 2, 50409 Tartu
  • molekulaar- ja rakubioloogia instituut
    Faculty phone: 
    737 5011
    Faculty address: 
    Riia 23, 23b–134, 51010 Tartu
  • Tartu observatoorium
    Faculty phone: 
    737 4510
    Faculty address: 
    Observatooriumi 1, Tõravere, 61602 Tartumaa
  • tehnoloogiainstituut
    Faculty phone: 
    737 4800
    Faculty address: 
    Nooruse 1, 50411 Tartu
  • ökoloogia ja maateaduste instituut
    Faculty phone: 
    737 5835
    Faculty address: 
    Vanemuise 46, 51003 Tartu
Asutused
  • raamatukogu
    Faculty phone: 
    737 5702
    Faculty address: 
    W. Struve 1, 50091 Tartu
  • teaduskool
    Faculty phone: 
    737 5581
    Faculty address: 
    Uppsala 10, 51003 Tartu
  • genoomika instituut
    Faculty phone: 
    737 4000
    Faculty address: 
    Riia 23b, 51010 Tartu
  • muuseum
    Faculty phone: 
    737 5674
    Faculty address: 
    Lossi 25, 51003 Tartu
  • loodusmuuseum ja botaanikaaed
    Faculty phone: 
    737 6076
    Faculty address: 
    Vanemuise 46, 51003 Tartu
Tugiüksused
  • ettevõtlus- ja innovatsioonikeskus
    Faculty phone: 
    737 6339
    Faculty address: 
    Lossi 3, III korrus, 51003 Tartu
  • grandikeskus
    Faculty phone: 
    737 6215
    Faculty address: 
    Lossi 3, III korrus, 51003 Tartu
  • hankeosakond
    Faculty phone: 
    737 6632
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a, 51005 Tartu
  • infotehnoloogia osakond
    Faculty phone: 
    737 6000, arvutiabi: 737 5500
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a, 51005 Tartu
  • kantselei
    Faculty phone: 
    737 5606
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a, 51005 Tartu
  • kinnisvaraosakond
    Faculty phone: 
    737 5137
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a, 51005 Tartu
  • personaliosakond
    Faculty phone: 
    737 5145
    Faculty address: 
    Ülikooli 18, ruumid 302 ja 304, 50090 Tartu
  • rahandusosakond
    Faculty phone: 
    737 5125
    Faculty address: 
    Jakobi 4, 51005 Tartu
  • rektoraadi büroo
    Faculty phone: 
    737 5600
    Faculty address: 
    Ülikooli 18, 51014 Tartu
  • siseauditi büroo
    Faculty address: 
    Ülikooli 17–103, 51005 Tartu
  • Tallinna esindus
    Faculty phone: 
    737 6600
    Faculty address: 
    Teatri väljak 3, 10143 Tallinn
  • turundus- ja kommunikatsiooniosakond
    Faculty phone: 
    737 5687
    Faculty address: 
    Ülikooli 18, ruumid 102, 104, 209, 210, 50090 Tartu
  • õppeosakond
    Faculty phone: 
    737 5620
    Faculty address: 
    Ülikooli 18, 50090 Tartu
  • üliõpilasesindus
    Faculty phone: 
    737 5400
    Faculty address: 
    Ülikooli 18b, 51005 Tartu
Muud üksused
  • MTÜ Tartu Ülikooli Akadeemiline Spordiklubi
    Faculty phone: 
    737 5371
    Faculty address: 
    Ujula 4, 51008 Tartu
  • MTÜ Tartu Üliõpilasküla
    Faculty phone: 
    740 9959
    Faculty address: 
    Narva mnt 25, 51013 Tartu
  • MTÜ Tartu Üliõpilasmaja
    Faculty phone: 
    730 2400
    Faculty address: 
    Kalevi 24, Tartu
  • OÜ Tartu Ülikooli Kirjastus
    Faculty phone: 
    737 5945
    Faculty address: 
    W. Struve 1, 50091 Tartu
  • SA Tartu Ülikooli Kliinikum
    Faculty phone: 
    731 8111
    Faculty address: 
    L. Puusepa 1a, 50406 Tartu
  • Tartu Ülikooli Sihtasutus
    Faculty phone: 
    737 5852
    Faculty address: 
    Ülikooli 18a–106, Tartu

bioinformaatika ja meditsiinilise genoomika vanemteadur

genoomika instituut
Tähtaeg:
16.09.2019
Tööülesanded
Otsime oma interdistsiplinaarsesse uurimisrühma kogemustega ja motiveeritud teadlast meditsiinilise- ja funktsionaalse genoomika, bioinformaatika, personaalmeditsiini või nendega seotud valdkondades. Dr. Anders Erikssoni poolt juhitud uurimisrühm on hiljuti loodud läbi Horizon 2020 projekti ERA Chair Center for Genomics, Evolution and Medicine (cGEM) ning selle eesmärgiks on ühendada bioinformaatika, evolutsioonibioloogia ja genoomilise meditsiini uurimisvaldkonnad. Tänu viimaseaja teooria- ja tehnoloogilistele arengutele on kõik need uurimisvaldkonnad teinud läbi plahvatusliku arengu, aga mahajäämus on interdistsiplinaarses teadustöös, mille tulemusel sageli ei kandu alusuuringute tulemused üle kliinilisse praktikasse ega formuleeru elujõulisteks teaduspõhisteks ettevõtlusideedeks. Uurimisrühma peamine ülesanne on ERA Chairi juhendamisel avada ja edendada sünergiat teaduse ja tehnoloogiate edasiarendamisel, luua teadustulemit, mis ületab väljakujunenud teadusuundasid luues seeläbi vastu võtvas instituudis uusi teaduse suundasid. Sellest lähtuvalt keskendub cGEM ERA Chair uurimisrühma teadustöö erinevate valdkondade andmete ja meetodite kombineerimisele, et uurida geneetilisi variatsioone, geenide avaldumist reguleerivaid mehhanisme ja keskkonna mõju geenide avaldumisel, mis põhjustavad komplekssete tunnuste varieerumist ning vastuvõtlikust haigustele populatsiooni sees ja erinvate populatsioonide vahel, ning uurida võimalusi nende tulemuste ülekandmiseks igapäevases meditsiinis rakendatavasse vormi ning ettevõtluskoostöö edendamiseks.

cGEM ERA Chair grupp pakub unikaalseid võimalusi selle uurimistöö läbiviimiseks, kuna uurimisrühm on integreeritud Genoomika instituudi ja Kliinilise meditsiini instituudi rahvusvaheliselt tunnustatud teadlaste kogukonda ning nende kasutada on unikaalsed ressursid nagu populatsioonipõhine biopank, mis sisaldab 200 000 proovi koos seotud geneetilise-, psühholoogilise- ja terviseandmetega, globaalne biopank, mis sisaldab üle 25 000 inimese DNA proove sadadest populatsioonidest, ning kaasaegne masinapark, sealhulgas teadusarvutuste keskus (hpc.ut.ee), kõrge läbilaskevõimega sekveneerimine, vana DNA labor jne. Lisaks on projekti raames võimalik võtta tööle üks teadur ja üks doktorant, kes viiksid läbi uurimustööd eduka kandidaadi juhendamisel.

Selle ametikoha peamised ülesanded on teadus- ja arendustöö läbiviimine meditsiinilise- ja funktsionaalse genoomika, bioinformaatika, personaalmeditsiini valdkonnas või seotud valdkondades; koostöö teiste teadusgrupi liikmetega loomaks sünergiat suuremahulise populatsioonipõhise biopanga, genoomi informaatika, populatsiooni- ja meditsiinigeneetika vahel; teaduri ja doktorandi juhendamine ning nende valikuprotsessis osalemine.

Peamised tööülesanded:
o Teadus-, arendus- ja loometegevus (TAL), vähemalt 70% tööajast järgmistes valdkondades: meditsiiniline ja funktsionaalne genoomika, bioinformaatika, personaalmeditsiin või nendega seotud valdkondades.
o Kõrgetasemeline TAL-tegevus, sh oma teadusteema TAL-tegevuse juhtimine, selleks vajalike vahendite olemasolu eest hoolitsemine ja TAL-tegevuse tulemuslikkuse eest vastutamine.
o Rahvusvahelisel tasemel teadustöö viie aasta jooksul vähemalt kahe doktoritöö mahus.
o TAL-tegevusse kaasatud akadeemiliste töötajate juhendamine.
o Osavõtt rahvusvahelise mõõtmega teaduskorraldustegevusest.
o TAL-tegevuseks vajalike oskuste arendamine ja enesetäiendus.
o Õppetöö ja õppetööalane korraldus- ja arendustegevus kuni 20% tööajast.
o Õppetöö tänapäevasel metoodilisel ja haridustehnoloogilisel tasemel, eelkõige üliõpilaste, sh doktorantide juhendamine.
o Enesetäiendamine õpetamis- ja juhendamisoskuste alal.
o Ülikooli juhtimises ning institutsionaalses arendamises osalemine, vähemalt 5% tööajast.
o Ühiskondlik tegevus, vähemalt 5% tööajast.
Vaata lisaks: ametijuhendit.
Nõutav kvalifikatsioon
Doktorikraad või sellele vastav kvalifikatsioon vastaval erialal.
Erialase kogemuse nõuded
Nõutud kogemused ja oskused:
o Riiklikul tasemel/rahvusvaheliselt tunnustatud teadustöö geneetika/genoomika valdkonnas.
o Suurepärane meeskonnatöö võimekus
o Tulemuslik kõrgetasemeliste publikatsioonide publitseerimine
o Riiklikul tasemel/rahvusvahelistel konverentsidel ettekandega osalemine
o Tulemuslik magistrantide ja/või doktorantide juhendamine
o Tugev organisatoorne võimekus
o Suurepärased suhtlemisoskused
o Võimekus kaasata, juhendada ja motiveerida kolleege


Soovitavad kogemused ja oskused:
o Tulemuslik erasektori koostöö kogemus
o Tulemuslik projektipõhise teadusrahastuse taotlemise kogemus
o Tunnustatud õpetamisoskused
o Meeskonna või projektijuhtimise kogemus
o Tudengite auditoorse õpetamise ja juhendamise kogemus
Keeleoskus
Inglise keele oskus rahvusvahelises koostöös teadustöö läbiviimiseks vajalikul tasemel.
Töölepingu algus
01.11.2019, töölepingu lõpp 31.08.2023
Koormus
1,00
Andmed töötasu kohta
Vastavalt Tartu Ülikooli palgaeeskirjale, sõltuvalt kandidaadi kvalifikatsioonist ja kogemusest kuni 3600 eurot kuus (bruto).
Vaata lisaks: palgaeeskirja.
Lisainformatsioon
Kandideerimisel palume esitada ka motivatsioonikiri, teadustöö eesmärk/plaan, vähemalt kahe soovitaja kontaktid.

Lisainfo saamiseks palun kontakteeruda järgmiste isikutega:

Dr. Anders Eriksson, cGEM ERA Chair, genoomika interdistsiplinaarsete uuringute uurimisrühma juht, anders.eriksson [ät] kcl.ac.uk
Dr. Mait Metspalu, Genoomika instituut, direktor, projekti vastutav täitja (PI), maitb [ät] ut.ee
Dr. Andres Salumets, Kliinilise meditsiini instituut, WP juht, andres.salumets [ät] ut.ee
Dr. Tõnu Esko, Genoomika instituut, Eesti Geenivaramu teaduskeskuse juht, tonu.esko [ät] ut.ee
Pr. Merit Kreitsberg, projektijuht, merit.kreitsberg [ät] ut.ee
Pr. Merilin Raud, juhiabi, merilin.raud [ät] ut.ee

www.genomics.ut.ee


Projekti täieliku kirjelduse ja täpsema info saamiseks ERA Chair’i uurimisrühma liikmete rollide kohta, võtke palun ühendust eespool nimetatud kontaktisikutega. Siit leiate kokkuvõtliku ülevaate projekti eesmärkidest, eeldatavast mõjust ja cGEM ERA Chair projekti tegevustest.

Üldine taust:

cGEM ERA Chair uurimisrühma eesmärk on rakendada genoomse meditsiini edusamme evolutsiooni-teadlikus raamistikus, võttes arvesse erinevaid evolutisooniradasid, mis on põhjustanud erinevusi levinud haiguste vastuvõtlikkuses. See nõuab põhjalikke teadmisi erinevate etniliste rühmade geneetiliste riskitegurite kohta ning asjakohaseid vahendeid, et tuua esile haiguste geneetiline eelsoodumus komplekssetes inimpopulatsioonides. Sellepärast toome kokku teadusliku kompetentsi kolmest institutsioonist - Eesti Biokeskuse (EBC) ja Eesti Geenivaramu (EGC), mis ühendati alates 1. jaanuarist 2018 Tartu Ülikooli Genoomika Instituudiks (IGUT), ja Kliinilise meditsiini instituut (ICM). Nende kolme teadusliku sõlmpunkti vahelise sünergiaga luuakse teadustöö suutlikkus eespool nimetatud eesmärgi lahendamiseks. See suutlikkus annab võimaluse rakendada terviklikku lähenemisviisi, et mõista levinud haigusi põhjustavaid evolutsioonilisi jõude; arendada erinevatesse populatsioonidesse rakendatavaid haiguse riski ennustamise mudeleid ja uurida võimalusi nende tulemuste üle kandmiseks igapäevases meditsiinis rakendatavasse vormi. Kõigil kolmel partneril on ainulaadsed ressursid, nagu näiteks biopank, kaasaegne infrastruktuur ja seadmed.

Eesti Geenivaramu arendab ja haldab 2000. aastal loodud populatsioonipõhist biopanka, milles on esindatud ligikaudu 20% Eesti täiskasvanud elanikkonnast (200 000 osalejat). Kogu biopanga kohordile on tehtud geenikaardid, mis võimaldavad analüüsida genoomis leiduvaid enim eristuvaid geenivariante, lisaks on 3000 inimesele tehtud terve genoomi sekveneerimine ja 2500le terve eksoomi sekveneerimine. Geenivaramu andmekogu on seotud riiklike terviseregistrite ja haiglate andmebaasidega ajakohastatud fenotüüpilise teabe saamiseks. Alustatud on individuaalse tagasisideme andmisega geenidoonoritele (polügeensed riskid, suured mõju alleelid ja kliiniliselt toimivad mutatsioonid) ning koostöö tugevdamine Kliinilise meditsiini instituudiga aitab kaasa alusuuringute viimisel tavapärasesse kliinilisse praktikasse. Samal ajal on EBC-l suurearvuline biopank (üle 25 000) inimese DNA proovidest sadadest erinevatest populatsioonidest Euraasias ja kaugemalgi, mis on olulise tähtsusega inimeste komplekshaiguste evolutsiooniliste liikumapanevate jõudude avastamisel.